Nesta temporada, Lula Molusco decide sair da Fenda do Biquíni, Bob Esponja adquire um mau hálito horrível e Plankton bola um plano para roubar o Krabby Patty.
Temporada 2 de Bob Esponja, com 36 episódios, estreou em 26/10/2000.
T2 E1Está Cheirando Alguma Coisa 26/10/2000
T2 E2Nas Botas do Chefe 26/10/2000
T2 E3Sapatos Desamarrados 02/11/2000
T2 E4O Dia de Folga do Lula Molusco 02/11/2000
T2 E5O Grande Fracassado Cor-de-Rosa 16/11/2000
T2 E6Amigo da Bolha 16/11/2000
T2 E7O Homem-Sereia e o Mexilhãozinho 3 27/11/2000
T2 E8Piadas de Esquilos 27/11/2000
T2 E9Natal Quem? 06/12/2000
T2 E10Morrendo Por Uma Torta 28/12/2000
T2 E11Imitação de Caranguejo 28/12/2000
T2 E12A Lagartinha 17/02/2001
T2 E13Hambúrguer Decepcionante 17/02/2001
T2 E14Sobrevivência dos Idiotas 05/03/2001
T2 E15Descartado 05/03/2001
T2 E16Beijos da Vovó 06/03/2001
T2 E17Cidade de Lula 06/03/2001
T2 E18Pilotar Sem Saber Não Vale 07/03/2001
T2 E19Sou Seu Maior Fã 07/03/2001
T2 E20Pressão 08/03/2001
T2 E21O Amendoim de Fumar 08/03/2001
T2 E22Marujo na Marra 09/03/2001
T2 E23Semana Pré-Hibernação 05/05/2001
T2 E24Vida de Crime 05/05/2001
T2 E25A Caixa Secreta 07/09/2001
T2 E26Doidos Pela Banda 07/09/2001
T2 E27Boca de Marinheiro 21/09/2001
T2 E28Artista Desconhecido 21/09/2001
T2 E29Caçador de Águas Vivas 28/09/2001
T2 E30Os Jogos do Mestre Cuca 28/09/2001
T2 E31Só Uma Mordida 05/10/2001
T2 E32O Incômodo 05/10/2001
T2 E33Lula em Greve 12/10/2001
T2 E34Sandy, Bob Esponja e a Minhoca 12/10/2001
T2 E35Delonga 30/11/2001
T2 E36Sou Pelos Idiotas 30/11/2001